Vaše geny mohou určit, zda vás koronavirus může poslat do nemocnice nebo ne (Themindunleashed.com)

Vědci začínají určovat, které z nich jsou důležité.

(KONVERZACE) - Když jsou někteří lidé infikováni koronavirem, pouze se rozvinou mírné nebo nezjistitelné případy onemocnění COVID-19. Jiní trpí vážnými příznaky a snaží se týdny dýchat na ventilátor, pokud přežijí.

Navzdory společnému celosvětovému vědeckému úsilí, lékaři stále přesně nevím proč je to tak.

Mohly by genetické rozdíly vysvětlit rozdíly, které vidíme v příznacích a závažnosti případů COVID-19?

Abychom to otestovali, použili jsme počítačové modely k analýze známých genetických variací v rámci lidského imunitního systému. THE výsledky našeho modelování naznačují, že ve skutečnosti existují rozdíly v DNA lidí, které by mohly ovlivnit jejich schopnost reagovat na infekci SARS COVID-2.

Co jsme udělali

Když virus infikuje lidské buňky, tělo reaguje zapnutím toho, co je v podstatě antivirový poplašný systém. Tyto alarmy identifikují virové vetřelce a říkají imunitnímu systému, aby vyslal cytotoxické T buňky – typ bílých krvinek – aby zničily infikované buňky a doufejme zpomalily infekci.

Ale ne všechny poplašné systémy jsou stejné. Lidé mají různé verze stejných genů – nazývaných alely – a některé z těchto alel jsou náchylnější k určitým virům nebo patogenům než ostatní.

Abychom otestovali, zda různé alely tohoto poplašného systému mohou vysvětlit část rozsahu imunitních reakcí na SARS-CoV-2, nejprve jsme získali seznam všech proteinů, které tvoří koronavirus v databáze Online.

Poté jsme vzali tento seznam a použili stávající počítačové algoritmy k předpovědi, jak dobře různé verze antivirového poplachového systému detekují tyto proteiny koronaviru.

Proč na tom záleží

Část poplašného systému, kterou jsme testovali, se nazývá systém lidského leukocytárního antigenu neboli HLA. Každý člověk má více alel genů, které tvoří jeho typ HLA. Každá alela kóduje jiný protein HLA. Tyto proteiny jsou senzory poplašného systému a nacházejí vetřelce vazbou na různé peptidy – řetězce aminokyselin, které tvoří části koronaviru – které jsou tělu cizí.

Jakmile se HLA protein naváže na virus nebo část viru, dopraví vetřelce na povrch buňky. To „označí“ buňku jako infikovanou a odtud imunitní systém buňku zabije.

Obecně platí, že čím více peptidů z viru dokáže HLA člověka detekovat, tím silnější je imunitní odpověď. Představte si to jako citlivější senzor poplašného systému.

Naše výsledky modelování předpovídají, že některé typy HLA se vážou na velký počet peptidů SARS-CoV-2, zatímco jiné se vážou na velmi málo peptidů. Jinými slovy, některé senzory mohou být pro SARS-CoV-2 vhodnější než jiné. Pokud ano, konkrétní alely HLA, které člověk má, by pravděpodobně byly faktorem účinnosti jeho imunitní odpovědi na COVID-19.

Vzhledem k tomu, že naše studie k vytvoření těchto předpovědí používala pouze počítačový model, rozhodli jsme se otestovat výsledky pomocí klinických informací z vypuknutí SARS v letech 2002-2004.

Našli jsme podobnosti v účinnosti alel při identifikaci SARS a COV-2. Pokud se jedna alela HLA zdála být špatná při rozpoznávání SARS CoV-2, byla špatná také při rozpoznávání SARS. Naše analýza předpověděla, že jedna alela, nazvaná B46:01, je zvláště špatná s ohledem na SARS-CoV-2 a SARS-CoV. Předchozí studie jistě ukázaly, že lidé s touto alelou mívají infekce. vážnější SARS a vyšší virovou zátěž než lidé s jinými verzemi genu HLA.

Jaký je další postup?

Na základě naší studie se domníváme, že variace v HLA genech částečně vysvětluje obrovské rozdíly v závažnosti infekce u mnoha pacientů s COVID-19. Tyto rozdíly v genech HLA pravděpodobně nejsou jediným genetickým faktorem, který ovlivňuje závažnost infekce COVID-19, ale mohly by být důležitým kouskem skládačky. Je důležité dále studovat, jak mohou typy HLA klinicky ovlivnit závažnost COVID-19, a otestovat tyto předpovědi na skutečných případech. Pochopení toho, jak mohou variace typů HLA ovlivnit klinický průběh COVID-19, by mohlo pomoci identifikovat jedince s největším rizikem onemocnění.

Pokud je nám známo, jedná se o první studii, která hodnotí vztah mezi virovými proteiny napříč širokým spektrem alel HLA. V současné době víme velmi málo o vztahu mezi mnoha jinými viry a typem HLA. Teoreticky bychom mohli tuto analýzu zopakovat, abychom lépe porozuměli genetickým rizikům mnoha virů, které v současnosti infikují nebo by mohly potenciálně infikovat lidi.

La Konverzace / Creative Commons

Názory vyjádřené v tomto článku nemusí odrážet redakční politiku The Mind Unleashed.

Zdroj: Themindunleashed.com

Dodatečné informace :

Crashdebug.fr: Covid-19: hypotéza o ústřední roli nikotinového acetylcholinového receptoru a jeho preventivních a terapeutických důsledcích (APHP)